Statistics for Integrative Biology

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Seminar 03/08/2012 – Détection d’interaction entre SNPs pour GWAS

Posted by SIB group on 17/02/2012

Détection d’interaction entre SNPs pour GWAS.
Mathieu Emily (Département MASS – Université de Rennes 2 et équipe de Statistiques de l’IRMAR , FRANCE).

Thursday, March, 8th, 2011 - 14.00

Salle précisée ultérieurement, bâtiment 24, Agrocampus OUEST (map)

Abstract (prochainement en ligne)


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Séminaire statistique 2/12/2011 – Single-sample SNP models: genotyping, copy number estimation and signal calibration

Posted by SIB group on 25/11/2011

Single-sample SNP models: genotyping, copy number estimation and signal calibration.
Ralph Rippe (Leiden University) nous présentera ses travaux dans le cadre des séminaires de l’équipe statistique de Rennes.

Friday, December, 2nd, 2011 - 11.00

Salle 2ème année, bâtiment 24, Agrocampus OUEST (map)

Abstract


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Seminar 11/17/2011 – Effet batch dans les données de puces à ADN

Posted by SIB group on 24/10/2011

Effet batch dans les données de puces à ADN
Delphine ROSSILLE (Département d’Hématologie – Département d’Information Médicale, CHU Rennes Pontchaillou, FRANCE )

Thursday, November, 17th, 2011 - 14.00

Salle 2ème année, bâtiment 24, Agrocampus OUEST (map)

Abstract


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JSTAR 2011 – AGROCAMPUS OUEST 20-21 October, 2011

Posted by SIB group on 11/10/2011

L’équipe de statistique de l’Irmar organise la 8ème édition des Journées de Statistique de Rennes (Jstar’11). Le programme de cette édition, concocté par Nolwenn Le Meur (EHESP), Mathieu Emily (Université Rennes 2), Valérie Monbet (Université Rennes 1) , Pierre Chagneau (INSA REnnes) et David Causeur (AGROCAMPUS OUEST Rennes), est plus particulièrement dédié aux applications de la statistique aux sciences du vivant (jeudi 20) et de l’environnement (vendredi 21). 

Toutes les informations sur le programme détaillé sont en ligne :

http://jstar2011.agrocampus-ouest.fr/

L’inscription est gratuite mais obligatoire (formulaire d’inscription)

October 20-21, 2011 Agrocampus Ouest, Rennes


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Ecole Thématique de Biogenouest du 7 au 9 Novembre 2011

Posted by SIB group on 10/10/2011

L’école thématique se tiendra du 7 au 9 Novembre 2011 au manoir de Kerdréan au Bono, près d’Auray.

Le programme d’école chercheurs et le formulaire d’inscription sont disponibles ici
Biogenouest Integrative Biology Project

November 7-9th, 2011 Manoir de Kerdréan au Bono près d’Auray


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Seminar 05/07/2011 – Tests multiples pour l’analyse des données génomiques

Posted by SIB group on 17/06/2011

Tests multiples pour l’analyse des données génomiques
David CAUSEUR (Laboratoire de mathématiques appliquées, Agrocampus-Ouest, Rennes, FRANCE)

Tuesday, July, 5th, 2011 – 14.00

salle 5ème année, bâtiment 24, Agrocampus OUEST (map)

Abstract


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Conference 06/07/2011 – Présentation du projet fédérateur Biologie intégrative de Biogenouest

Posted by SIB group on 24/05/2011

Présentation du projet fédérateur Biologie intégrative de Biogenouest
Yvan LE BRAS (animateur du projet fédérateur “Biologie intégrative” de Biogenouest)

Tuesday, June 7th, 2011 – 12h30
Bâtiment 13, campus santé (map)
on the occasion of IFR 140‘s conferences

more information: seminar webpage

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Seminar 19/04/2011 – Une étude comparée de listes de gènes différentiels générées par séquençage haut-débit [454 - Roche] et micro-réseaux d’ADN [Agilent]

Posted by SIB group on 30/03/2011

Une étude comparée de listes de gènes différentiels générées par séquençage haut-débit [454 - Roche] et micro-réseaux d’ADN [Agilent]
Gregory GUERNEC (INRA UR1037 SCRIBE, Campus de Beaulieu, 35000 – Rennes, FRANCE)

Tuesday, April, 19th, 2011 – 14.00

salle 1ère année, bâtiment 24, Agrocampus OUEST (map)

NEWSlides, list of R packages and abstract on seminar webpage

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Statistical Methods for Post-Genomic Data workshop / Paris

Posted by SIB group on 20/01/2011

The 2011 edition of Statistical Methods for Post-Genomic Data workshop, SMPGD’11, will take place at Paris on the 27th and 28th of January 2011. Three sessions are more specifically developed through courses exempted by experienced researchers:

  • Multiple testing
  • High-throughput sequencing
  • Statistical genetics

One session is devoted to all statistical aspects of genomic and post-genomic data analysis.

M.Verbanck’s presentation: abstract (pdf) – slides (pdf)
Constitution of modules of genes combining coexpression and biological knowledge when interpreting transcriptomic data in an exploratory framework
Marie Verbanck & Sébastien Lê

SMPGD’2011 website

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One-week course: Statistical analysis of post-genomic data / Agrocampus, Rennes

Posted by SIB group on 15/01/2011

A one-week course on Statistical analysis of post-genomic data is organised in Agrocampus, Rennes, January 2011, 17-21.

Program:

  • Day1
    • Presentation of the course
    • Introduction to R
    • Data normalisation and experimental design
  • Day 2
    • Differential analysis
  • Days 3 and 4
    • Classification
  • Day 5
    • Example

More information on the Courses web-page

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